| デザイン詳細、目的、手法 | 論文タイトルもしくはアジレント資料タイトル（[ ]内はPMID） |
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| Whole Exome Sequencing のためのデザイン |
信頼のおける先進的なテクノロジーを 活用した、高性能なエクソーム
アジレント データシート [5994-3154JAJP]
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| イヌ、ウマ Exome デザイン |
Cross-species genomic landscape comparison of human mucosal melanoma with canine oral and equine melanoma.
Nat Commun. 2019 [30664638] |
| プロモーターキャプチャーHi-C法 (1) |
Identification of Mechanisms by Which Genetic Susceptibility Loci Influence Systemic Sclerosis Risk Using Functional Genomics in Primary T Cells and Monocytes.
Arthritis Rheumatol. 2023 [36281738] |
| プロモーターキャプチャーHi-C法 (2) |
Promoter Capture Hi-C: High-resolution, Genome-wide Profiling of Promoter Interactions.
J Vis Exp. 2018 [30010637] |
| ATL や悪性リンパ腫に関連する遺伝子に加え、Provirus プローブで変異やインテグレーションサイト、clonality を解析可能なデザイン |
Chronological genome and single-cell transcriptome integration characterizes the evolutionary process of adult T cell leukemia-lymphoma.
Nat Commun. 2021 [34376672] |
| AAV の integration の検出 |
Comparing molecular and computational approaches for detecting viral integration of AAV gene therapy constructs.
Mol Ther Methods Clin Dev. 2023 [37251978] |
| メタゲノムサンプルからの特定の細菌の濃縮（農産物の病害細菌解析） |
SureSelect targeted enrichment, a new cost effective method for the whole genome sequencing of Candidatus Liberibacter asiaticus.
Sci Rep. 2019 [31831765] |
| 植物病害耐性に関する遺伝子ファミリーの SNP を同定 |
NLR diversity and candidate fusiform rust resistance genes in loblolly pine.
G3 (Bethesda). 2022 [34897455] |
| Virus、Bacteria の WGS のためのターゲットエンリッチメント |
Utilization of Agilent SureSelect Target Enrichment for Whole Genome Sequencing of Viruses and Bacteria.
Agilent Application Note [5994-0909EN] |
| トキソプラズマゲノムのキャプチャ |
Far-East Asian Toxoplasma isolates share ancestry with North and South/Central American recombinant lineages.
Nat Commun. 2024 [38778039] |
| ウイルスゲノム (SARS-CoV-2) シーケンス解析 |
ハイブリダイゼーションキャプチャ法による SARS-CoV-2 ウイルスゲノムの シーケンス解析
アジレント アプリケーションノート [5994-4538JAJP] |
| ゲノム編集の off target の評価 |
CRISPR-Cas3 induces broad and unidirectional genome editing in human cells.
Nat Commun. 2019 [31811138] |
| エピジェネティクス研究デザイン |
Detecting Systemic Interindividual Epigenetic Variation With The Agilent SureSelect CD Baylor Human CoRSIV Panal [5994-5914EN] |
| ⻑寿の特徴を反映するエピジェネティックな因⼦の探索 |
Epigenetic profile of Japanese supercentenarians: a cross-sectional study
[36738748] |
| 高解像度全エクソームと低解像度全ゲノムを組み合わせた遺伝子研究のための費用対効果の高いシーケンス法 |
A cost-effective sequencing method for genetic studies combining high-depth whole exome and low-depth whole genome.
NPJ Genom Med. 2024 [38326393] |
