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 Agilent DNA マイクロアレイ スキャナ キャンペーン(2010.10.29まで)
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 次世代シーケンシング:Agilent 2100 バイオアナライザで出発DNAとシーケンシングライブラリを確認
◆プレスリリース
 アジレントのターゲット DNA 濃縮キットがバーコーディングとマルチプレックスシーケンスに対応。シーケンシングを高速化し、コストを最大で 1/16 に低減可能 (2010/4/23)

 アジレント・テクノロジー、ヒトゲノムの全エクソン領域をキャプチャするSureSelectタ ーゲット DNA 濃縮キットを発表(2009/10/15)

 アジレントが、プローブ密度を4倍に高めた第三世代マイクロアレイを発表(2009/3/31)
 アジレントが、研究者の関心のある部分のみを解析可能にすることで、次世代DNAシーケンシングの高効率化を実現するシステムを発表(2009/3/31)
CNV関連:11の疾病の遺伝子的原因の解明に向けたWTCCCプロジェクトが始動
 
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アジレントアレイの受託解析
 
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ヒトゲノムの解読によって、科学には新しい時代が到来しました。複雑な生体を系統的に明らかにすることが可能になったのです。細胞内に存在する全ての既知の遺伝子を同時測定する技術は、今日の研究環境においては、当たり前のものとなっています。

アジレントは、遺伝子発現の分野のソリューションプロバイダーの先駆者として、世界の主要な研究機関が提起する困難な問題を解決するお手伝いをいたします。


   
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製品・ソリューション
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サポート(遺伝子リスト/必要なものリスト/お客様専用サポートサイト等へのリンク)
 製品 : アジレント ゲノミクス・トータルソリューション
バイオアナライザ
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試薬(発現)
遺伝子発現用:ラベル化
Low Input Quick Amp /
  Quick Amp
スパイクイン(1色 / 2色
ハイブリダイゼーション
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miRNA用:ラベル化&ハイブリスパイクイン
(洗浄は遺伝子発現と同じ)
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ハイブリダイゼーション
25反応 / 大容量
洗浄(バッファ
ChIP-on-a-chip/メチル化用:
ラベル化(酵素反応
(洗浄はCGH/CNVと同じ)
【読み物】 CGH/CNV マイクロアレイの自動処理によりスループットを向上 (Access Agilent 2009年12月号より)
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リアルタイムPCR装置
Mx3000P / Mx3005P
QPCR&QRT-PCR試薬
ゲノムキャプチャ 5/25update
SureSelect概要
Human All Exon キットupdate
  Human All Exon プラスカスタムキット 
 

インデックスカスタムキット
Illumina GA 
AB SOLiD 

  X 染色体キット update
ベイト設計ガイド(インデックスカスタム、Human All Exonプラスカスタム対応) update
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 論文・技術資料・アプリケーション等
1 : 論文紹介 (Open Genomics)
2 : 技術資料・アプリケーションノート
3 : セミナー資料&参考資料
 
1: 論文紹介
 
おすすめ論文 
  Nature GeneticsのCNV特集号(過去の重要なCNV論文をまとめたものです)

注目論文 Why it's interesting  2010/7/8 update
  "microRNA as a new immune-regulatory agent in breast milk ", Silence 2010
miRNA : 最近、血液をはじめとする体液に安定に存在するmiRNAが、バイオマーカーとして利用できるとして、そのプロファイリングを得る様々な試みがなされています。本研究では、Agilent Human miRNAマイクロアレイを用いて、健常人の母乳中のmiRNAの発現が検出され、免疫機能に関与するmiRNAが産後6カ月間の母乳で多く発現していることが明らかにされました。また筆者らはmiRNAの安定性についても確認し、母乳中に安定に存在するmiRNAが乳児の胃腸などの厳しい環境にも耐えて吸収され、乳児の免疫機能にまで影響を及ぼしている可能性を示唆しました。
"Concordance among digital gene expression, microarrays, and qPCR when measuring differential expression of microRNAs", BioTechniques 2010
miRNA : 近年、Total RNA から miRNA を網羅的にプロファイリングする技術が急速に進歩し、より簡単に正確に検出するための改良が進んでいます。本報告では、市販の標品 total RNA を用いて、Agilent 社製を含めた複数の miRNA マイクロアレイプラットフォーム、次世代シーケンサによる Digital Gene Expression(DGE)および qPCR による定量結果が比較されました。その結果、テクノロジーの違いを超えて、Agilent 製アレイ、DGE および qPCR の結果が最もよく一致することが示されました。また、他社製マイクロアレイでは増幅時のバイアスが結果に影響するのに対し、エンドラベル化法を用いる Agilent 社のプロトコルでは、よりバイアスの少ない検出が可能であると考察されています。
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掲載開始日 12/09/2008
2: 技術資料・アプリケーションノート
技術資料
 Click to Play (22MB) ※ (動画のクオリティを改善しました)

アレイ製造 : インクジェットテクノロジー概要(動画) Video - Agilent SurePrint Ink-jet Printing Technology, Improving Platfrom Sensitivity ※この動画ファイルをご覧いただくには、Quicktimeが必要になります。Quicktimeはこちらからダウンロード(無償)できます。

論文・科学文献リスト

バイオアナライザを使った論文リスト(論文数>7300) Collection of external publications and scientific citations for the 2100 Bioanalyzer - Jan 08

アプリケーションノート
5989-6624EN

CGH : A Robust Whole Genome Amplification Method for Agilent Array-based Comparative Genome Hybridization Analysis (全ゲノム増幅と組み合わせたCGH解析)

5989-8539EN

バイオアナライザ : A nalysis of small RNAs from Drosophila Schneider cells using the Small RNA assay on the Agilent 2100 bioanalyzer(低分子RNAの高感度・高分離アッセイ)

5989-2982JAJP

バイオアナライザ : Agilent 2100 バイオアナライザによる食用魚類の魚種同定

5989-3107JAJP

バイオアナライザ : 2100 バイオアナライザを利用したミトコンドリアDNA PCR の最適化

5989-0985JAJP

バイオアナライザ : Agilent 2100バイオアナライザとDNA 500ラボチップによるPCR増幅ミトコンドリアDNAの分析

5988-4847JAJP

バイオアナライザ : Agilent 2100バイオアナライザによる遺伝子組み換え作物の検出

 

PDF版はこちら (304KB)

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3: セミナー資料 & 参考資料
■セミナー資料
論文一覧はこちら

アジレント・ゲノミクステクノロジーのアプリケーションサイエンティストは、様々な内容のテクニカルセミナーを全国各地で開催しています。マイクロアレイとは?マイクロアレイで何が分かる?といった基礎的なものから、次世代遺伝子発現プロファイリングの最大の特徴である「高感度化の効果」を低発現遺伝子の検出とオントロジー解析の実例から紹介したり、免疫沈降法を組み合わせた転写因子やクロマチンレギュレータのゲノム結合解析のソルーション、さらには、最新論文紹介を交えたmRNA-miRNA統合解析!といった応用まで、お客様の要望に合わせたセミナーを展開しています。その中から、いくつかのプレゼンテーション資料をピックアップしました。

セミナー資料

マイクロアレイとは?マイクロアレイで何が分かる?そんなあなたの疑問にお答えします。

PDFダウンロードはこちら
(2.8MB)

次世代高感度マイクロアレイ"5 logのダイナミックレンジ"がもたらす効果を、低発現遺伝子の検出とオントロジー解析の実例から御紹介します。

高感度オリゴアレイが変えるCGH/CNV解析。CGH(Comparative Genomic Hybridization)解析の基礎と実験・解析の実際を通してご紹介します。

独自のアレイ検出プローブ設計、独自のエンドラベリング、等を組み合わせたアジレントの高感度miRNA発現解析のトータルソルーションをご紹介します。

転写ネットワークや幹細胞・癌のエピジェネティクスを解明するための ChIP-on-chip/DNA メチレーション解析のソルーションをご紹介します。

アジレントが提供するウエブベースのカスタムアレイデザインツール、eArrayをご紹介します。(v6.5対応)

アジレントが提供する新製品SureSelectターゲットエンリッチメントシステムの概要をご紹介します。このシステムにより、興味のあるゲノム領域に的を絞ってゲノムを濃縮し、次世代シーケンサの解析における時間とコストと解析労力を一気に低減することが出来ます。

ゲノム研究の進展に伴い、DNA の量的変化を生じるコピー数多型 (Copy Number Variants : CNV) が高い頻度でヒトゲノム中に存在することが明らかになり、生活習慣病や自己免疫疾患を含むヒトの形質差に影響を与えている可能性が大きな注目を集めています。最新の CNV 研究の一端をご紹介します。


■参考資料 : 機関紙 「Strategies」 にマイクロアレイとバイオアナライザの特集記事を掲載
論文一覧はこちら

PCR酵素pfu、コンピテントセル、変異導入キット、リアルタイムPCRシステムなど分子生物学の実験に欠かせない様々な試薬類の販売しているSTRATAGENE部門では、20007年から、さまざまな生物学の実験における問題点と解決法を記した機関紙「Strategies」の日本語版を発行しています。STRATAGENE部門がアジレント・テクノロジーの一部門となったことで、アジレントのマイクロアレイやバイオアナライザの製品群を中心としたゲノミクスの研究における問題点と解決法を提供することが可能となりました。今後もゲノミクスの様々な問題に対し、優れた解析システムを中心とする様々なソリューションを具体的に示していきます。

一括ダウンロード

「Stratagies」最新号(それぞれの特集記事を下記からダウンロードすることも出来ます)

特集記事

アジレントDNAマイクロアレイ ゲノミクストータルソリューション

比類なき5logのダイナミックレンジがもたらすインパクト

GeneSpringGX によるマイクロアレイデータ解析アプローチ

遺伝子発現マイクロアレイサンプルの Quality Check

Agilent 2100 バイオアナライザによるリアルタイムPCR実験の検証

高感度タンパク質分析を実現したバイオアナライザ用新アッセイキット

バイオアナライザFAQ (購入前のお問い合わせ)

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 サポート

■トレーニングコース  

アジレント・テクノロジー株式会社では、マイクロアレイのカストマトレーニングを開催しております。

  • 遺伝子発現マイクロアレイ(実験・数値化を含む2日間の実習)
  • アレイCGH(実験・数値化を含む2日間の実習)
  • miRNAマイクロアレイ(実験・数値化を含む2日間の実習)
  • Agilent Genomic Workbench CGH解析 (CGHの解析概念から解析手法までの1日間のPC操作)

   ⇒日程の確認・お申し込みはこちら

■マイクロアレイ情報のダウンロードサイト

ダウンロード
コンテンツ
必要なもの
eArray

デザインファイル・GeneList・Annotationsを含む、マイクロアレイの色々な情報が一括してダウンロードできます

事前のユーザー登録
※ アレイを注文される前に、上記のリストをダウンロードし、研究の目的に沿ったアノテーションがついた遺伝子が搭載されているかどうかをご確認ください。

■SureSelect Target Enrichment Systemを使用する際に必要なものリスト

必要なものリスト 

イルミナ カスタムキット(シングルエンド用)に必要な試薬・器具類の一覧です

イルミナ カスタムキット(ペアエンド用)に必要な試薬・器具類の一覧です (Human All Exon(プラスカスタムキット)、インデックスキットを除く)

イルミナ Human All Exon およびプラスカスタムキット(ペアエンド用)に必要な試薬・器具類の一覧です

イルミナ カスタムインデックスキット(ペアエンド、マルチプレックス用)に必要な試薬・器具類の一覧です

SOLiD Human All Exonおよびプラスカスタムキット(フラグメント用)に必要な試薬・器具類の一覧です

SOLiD カスタムインデックスキット(フラグメント、バーコード用)フラグメントライブラリ用に必要な試薬・器具類の一覧です

■アジレントマイクロアレイ実験に必要なもののリスト

必要なものリスト 2010/7/16 update

CpGアイランドアレイを始めるのに必要な試薬・器具類の一覧です

update 遺伝子発現アレイ(Low Input Quick Amp キット)を始めるのに必要な試薬・器具類の一覧です

遺伝子発現アレイ(Quick Amp キット)を始めるのに必要な試薬・器具類の一覧です

PDFダウンロードはこちら

アレイCGHを始めるのに必要な試薬・器具類の一覧です

miRNAアレイを始めるのに必要な試薬・器具類の一覧です

ChIP-on-chip (Mammalian) を始めるのに必要な試薬・器具類の一覧です

ChIP-on-chip (Yeast) を始めるのに必要な試薬・器具類の一覧です

■GeneSpring 操作説明資料と FAQ  2010/7/16 update

GeneSpring GX11

インストールガイド

ベーシックトレーニングテキスト

ここをクリック

その他のドキュメント・FAQ

■実験マニュアル

プロトコル一覧(英語)
※遺伝子発現、CGH、miRNAの実験プロトコル(日本語)は、下記のサポートページから入手できます。

■カストマ E-mail ニュース 

アジレント・テクノロジー株式会社では、弊社製品をご使用頂いて実験を行う実務者のお客様を対象に、テクニカルサポートからのE-mailニュースを定期的に配信しています。

実験プロトコルのアップデート・新製品のご案内・実験に関するトラブルシュート・試薬や消耗品の保存など、実験を成功させるための技術的な内容に限定して、月1 回程度E-mail をお送りしています。受信をご希望の方は、お名前・ご所属・受信を希望するE-mail アドレスと、下記3種類のうちいずれのカストマニュース受信希望かを明記して、

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