SurePrint オリゴヌクレオチドライブラリ（オリゴプール）

SurePrint オリゴヌクレオチドライブラリ（オリゴプール）

[RUO]

アジレントのオリゴヌクレオチドライブラリ合成プラットフォームは、世界で最も高い技術を誇り信頼できる製造スケールのアレイベースで合成したオリゴ DNA を提供します。
マイクロアレイの製造で使用している SurePrint プラットフォームを活用し、より優れた性能のライブラリを作成することに成功しました。
本製品、オリゴヌクレオチドライブラリは、研究目的に合わせてデザインするカスタム製品です。
グレード (Standard / HiFi)、オリゴ DNA 長、オリゴ DNA 種類をお選びいただき、デザイン通りに合成される様々な種類のオリゴ DNA を 1 本のチューブにまとめ、「プール型ライブラリ」としてお届けします。

※製品はすべて試験研究用です。診断目的にご利用いただくことはできません。

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特長

  • カスタムデザイン：さまざまなアプリケーションや実験にフレキシブルに対応
  • 様々な種類のオリゴ DNA を安定した状態で並列合成
  • 高い Fidelity：エラー率は Standard で約 0.4％、HiFi で約 0.1%
  • 均一な Representation：90% 以上のオリゴが平均数の 1.6x 以内
  • オリゴ数：244,000 種類まで
  • オリゴ長：30 〜 230 ntの間で選択可能
  • アジレントのライブラリ合成の利点

    高品質で長いオリゴヌクレオチドライブラリの作製は、カスタムオリゴヌクレオチドの複雑なプールの合成から始まります。アジレントは、インクジェット技術に基づく独自のアレイベースの合成法 (SurePrint 技術)により、個々の塩基をスライド上の定義された位置に合成します。オリゴヌクレオチドはスライドから切り離され、プール後、凍結乾燥され、1本のチューブでお客様もとに届きます。オリゴライブラリを再懸濁し増幅することで、さまざまな下流のアプリケーションで使用することができます。

  • 優れたFidelityとRepresentation

    オリゴライブラリを選択する際に考慮すべき重要な要素は、FidelityとRepresentationです。アジレントのライブラリは、SurePrintプラットフォームで合成されます。Representationとは、プール内の各オリゴ配列の相対的な存在量のことです。Agilent SurePrint ライブラリは、Standardでは0.4%、HiFiでは0.1%とエラー率が低く、高いRepresentationを持っているため、より明確な結果の取得とスクリーニング時間の短縮につながります。

  • 長鎖オリゴ合成

    タンパク質、ゲノム、抗体工学、MPRA、遺伝子アセンブリ、その他多くのアプリケーションには、長鎖オリゴのプールDNAライブラリが不可欠です。アジレントは、長いオリゴの合成において技術的なスペシャリストでした。従来の合成法では、長さが50ヌクレオチド程度を超えると、多くの欠失が蓄積されるようになります。この時点で収量が低くなり、効率的にオリゴを合成・精製することができなくなります。SurePrint 技術を用いることで、230塩基までの長鎖オリゴの合成が可能となりました。

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製品情報

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アプリケーション例

  • 大規模な人工遺伝子合成
  • shRNA ライブラリ
  • ペプチドライブラリ
  • ハイスループットレポーターアッセイ など

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参考情報

  • 出版物
  • 1. L. Cao et Al., De novo design of picomolar SARS-CoV-2 miniprotein inhibitors. Science (2020). DOI: 10.1126/science.abd9909>詳しくはこちら
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  • 3. Davis et al., Cell Systems 11, 75–85, July 22, 2020, https://doi.org/10.1016/j.cels.2020.05.011 
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  • 6. Nicholas Bogard, Johannes Linder, Alexander B. Rosenberg, Georg Seelig, A Deep Neural Network for Predicting and Engineering Alternative Polyadenylation, Cell, Volume 178, Issue 1, 2019, Pages 91-106.e23, ISSN 0092-8674, https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.04.046. 
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  • 8. John P. Ray, Carl G. de Boer, Charles P. Fulco, Caleb A. Lareau, Masahiro Kanai, Jacob C. Ulirsch, Ryan Tewhey, Leif S. Ludwig, Steven K. Reilly, Drew T. Bergman, Jesse M. Engreitz, Robbyn Issner, Hilary K. Finucane, Eric S. Lander, Aviv Regev & Nir Hacohen. Prioritizing disease and trait causal variants at the TNFAIP3 locus using functional and genomic features. Nature Communications (2020) 11:1237. Epub https://doi.org/10.1038/s41467-020-15022-4 | www.nature.com/naturecommunications
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  • 11. Hoffmann, H.-H., Sánchez-Rivera, F.J., Schneider, W.M., Luna, J.M., SotoFeliciano, Y.M., Ashbrook, A.W., Le Pen, J., Leal, A.A., Ricardo-Lax, I., Michailidis, E., Hao, Y., Stenzel, A.F., Peace, A., Zuber, J., Allis, C.D., Lowe, S.W., MacDonald, M.R., Poirier, J.T., Rice, C.M., Functional interrogation of a SARS-CoV-2 host protein interactome identifies unique and shared coronavirus host factors, Cell Host and Microbe (2021), doi: https://doi.org/10.1016/j.chom.2020.12.009. 
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