SurePrint オリゴヌクレオチドライブラリ

SurePrint オリゴヌクレオチドライブラリ

[RUO]

アジレントのオリゴヌクレオチドライブラリ合成プラットフォームは、世界で最も高い技術を誇り信頼できる製造スケールのアレイベースで合成したオリゴ DNA を提供します。
マイクロアレイの製造で使用している SurePrint プラットフォームを活用し、より優れた性能のライブラリを作成することに成功しました。
本製品、オリゴヌクレオチドライブラリは、研究目的に合わせてデザインするカスタム製品です。
グレード (Standard / HiFi)、オリゴ DNA 長、オリゴ DNA 種類をお選びいただき、デザイン通りに合成される様々な種類のオリゴ DNA を 1 本のチューブにまとめ、「プール型ライブラリ」としてお届けします。

※製品はすべて試験研究用です。診断目的にご利用いただくことはできません。

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特長

  • カスタムデザイン：さまざまなアプリケーションや実験にフレキシブルに対応
  • 様々な種類のオリゴ DNA を安定した状態で並列合成
  • 高い Fidelity：エラー率は Standard で約 0.4％、HiFi で約 0.1%
  • 均一な Representation：90% 以上のオリゴが平均数の 1.6x 以内
  • オリゴ数：244,000 種類まで
  • オリゴ長：30 〜 230 ntの間で選択可能
  • アジレントのライブラリ合成の利点

    高品質で長いオリゴヌクレオチドライブラリの作製は、カスタムオリゴヌクレオチドの複雑なプールの合成から始まります。アジレントは、インクジェット技術に基づく独自のアレイベースの合成法 (SurePrint 技術)により、個々の塩基をスライド上の定義された位置に合成します。オリゴヌクレオチドはスライドから切り離され、プール後、凍結乾燥され、1本のチューブでお客様もとに届きます。オリゴライブラリを再懸濁し増幅することで、さまざまな下流のアプリケーションで使用することができます。

  • 優れたFidelityとRepresentation

    オリゴライブラリを選択する際に考慮すべき重要な要素は、FidelityとRepresentationです。アジレントのライブラリは、SurePrintプラットフォームで合成されます。Representationとは、プール内の各オリゴ配列の相対的な存在量のことです。Agilent SurePrint ライブラリは、Standardでは0.4%、HiFiでは0.1%とエラー率が低く、高いRepresentationを持っているため、より明確な結果の取得とスクリーニング時間の短縮につながります。

  • 長鎖オリゴ合成

    タンパク質、ゲノム、抗体工学、MPRA、遺伝子アセンブリ、その他多くのアプリケーションには、長鎖オリゴのプールDNAライブラリが不可欠です。アジレントは、長いオリゴの合成において技術的なスペシャリストでした。従来の合成法では、長さが50ヌクレオチド程度を超えると、多くの欠失が蓄積されるようになります。この時点で収量が低くなり、効率的にオリゴを合成・精製することができなくなります。SurePrint 技術を用いることで、230塩基までの長鎖オリゴの合成が可能となりました。

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アプリケーション例

  • 大規模な人工遺伝子合成
  • shRNA ライブラリ
  • ペプチドライブラリ
  • ハイスループットレポーターアッセイ など

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参考情報

  • 出版物
  • 1. L. Cao et Al., De novo design of picomolar SARS-CoV-2 miniprotein inhibitors. Science (2020). DOI: 10.1126/science.abd9909>詳しくはこちら
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  • 11. Hoffmann, H.-H., Sánchez-Rivera, F.J., Schneider, W.M., Luna, J.M., SotoFeliciano, Y.M., Ashbrook, A.W., Le Pen, J., Leal, A.A., Ricardo-Lax, I., Michailidis, E., Hao, Y., Stenzel, A.F., Peace, A., Zuber, J., Allis, C.D., Lowe, S.W., MacDonald, M.R., Poirier, J.T., Rice, C.M., Functional interrogation of a SARS-CoV-2 host protein interactome identifies unique and shared coronavirus host factors, Cell Host and Microbe (2021), doi: https://doi.org/10.1016/j.chom.2020.12.009. 
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