MassHunter ワークステーション用 Spectrum Mill

優れたスペクトル抽出速度によるタンパク質の同定

タンパク質の同定は通常、タンパク質データベース検索によって行われます。Spectrum Mill ソフトウェアがタンパク質データベースを検索する極限の速度と効率は、主に、検索を開始する前のインテリジェントなデータ抽出と処理によるものです。ノイズによるスペクトルと低品質なスペクトルを同定し、除外することによって、検索速度は大幅に向上します。スペクトル抽出では、抽出を使用しないプログラムとは異なり、偽陽性の数も削減します。データ抽出ソフトウェアには、以下の機能があります。

  • 最小限のシーケンスタグの長さと S/N パラメータを使用し、低品質のスペクトルを除外する
  • データファイルのサイズを小さくするセントロイドデータを使用する
  • 荷電ペプチドプリカーサをマージしないように、MS/MS スペクトルを同様に比較した後、指定された時間内で同じプリカーサからのスキャンをマージする
  • 可能な場合には、同位体パターンを基にして荷電状態を求める
  • オプションの MS2 および MS3 スペクトルのマージ（ホスホプロテオミクスの場合は必要）