DNA ソリューション
- Cell-free DNA

TapeStation

DNA ソリューション
- Cell-free DNA

[RUO]

アジレントの Cell-free DNA ScreenTape システムは、cell-free DNA (cfDNA) サンプルの信頼性の高い電気泳動解析を自動で行うことができます。Cell-free DNA ScreenTape アッセイでは、正確な定量、サイズ決定、cfDNA の割合(%cfDNA)が計算できます。 %cfDNA は、サンプルの品質評価のための客観的で再現性のある値です。目的サンプル中の cfDNA の量を自動的に計算します。cfDNA の濃度、サイズ、品質を1サンプルあたり 2 分未満でデジタル評価します。

Cell-free DNA アッセイは、Agilent 4150 および 4200 TapeStation システムにご利用いただけます。

製品はすべて研究用です。その他の用途にご利用いただくことはできません。

型番 製品 数量   
5067-5630 Cell-free DNA ScreenTape 1 ScreenTape 7 枚(最大112サンプル分)。必ず Cell-free DNA 試薬キットが必要です。
5067-5631 Cell-free DNA 試薬キット 1 最大 112 サンプル分。必ず Cell-free DNA ScreenTape が必要です。Cell-free DNA ラダが含まれています。
5067-5632 Cell-free DNA ラダ 1 50 µl(2 μL/回)入り。Cell-free DNA アッセイ専用。サイズを正確に測定する場合に必要となります。Cell-free DNA 試薬キットに含まれています。
5067-5633 Cell-free DNA サンプルバッファ 1 最大 112 サンプル分。必ず Cell-free DNA ScreenTape が必要です。Cell-free DNA 試薬キットに含まれています。サイズを正確に測定する場合は、Cell-free DNA ラダ が必要です。

※ソフトウェアver 3.2 以上が必要です。2200 TapeStation ではご使用いただけません。

 

figure2

Cell-free DNA の定量と定性

Cell-free DNA は約 170 bp に顕著なピークを示し、これは 1 つのヒストンタンパク質に結合したモノヌクレオソーム DNA フラグメントを表します。
その高分子側にヌクレオソーム多量体である DNA 断片も確認できます。
一部のサンプルでは、700 bp を超える HMW DNA も検出される場合があります。
Cell-free DNA ScreenTape アッセイは、近年注目されるcfDNA サブコンポーネントの割合を示す %cfDNA が自動計算されます。


図:Cell-free DNA ScreenTape アッセイで分析した cfDNA の特性プロファイル。エレクトロフェログラムは、モノヌクレオソーム、その二量体、高分子量(HMW)DNA を示します。多量体の DNA フラグメントは %cfDNA 領域(50〜700 bp)に含まれ、HMW DNA は含まれません。

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特長

  • サンプル内の 50~800 bp の cell-free DNA (cfDNA) の定量およびサイズを決定。さらに高分子量 (HMW) DNA の混入も検出可能
  • 検出感度は 20 pg/μL (定量範囲: 100~4,000 pg/µL)
  • %cfDNA (50~700 bp の割合)のデジタル品質評価。解析時間は 1~2 分 / サンプル
  • スタートサンプルの品質確認により、次世代シーケンシングワークフローにおいてシーケンシングおよびサンプル調製の最適化が可能
  • Ready-to-use の ScreenTape とデータの自動解析による高い再現性
  • ScreenTape の未使用レーンは再利用可能 ( 使用期限: 2週間 )

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仕様

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ソフトウェア

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