NGS FFPE QC キット

SureSelect/HaloPlex ターゲットエンリッチメントシステム

NGS FFPE QC キット

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルから抽出された DNA は、断片化や、タンパク質との架橋、一本鎖DNA の割合が高いなどの理由で、アダプターライゲーションや DNA 増幅の効率が低下し、シーケンスライブラリの作成が困難な場合があります。
Agilent NGS FFPE QC キットは、次世代シーケンシングライブラリの調製を行う前に、使用するヒトゲノム DNA の品質チェックと定量を行う qPCR ベースのキットです。長さの異なる2 種類のアンプリコンの増幅を比較することで算出される Sample Quality Score(ΔΔCq)と定量値を用いて、FFPE サンプルにおける最適なNGS パフォーマンスを得るための具体的な指標を提供します。

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特長

  • DNA サンプルの品質チェックと定量
  • ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプル由来の DNA など、条件の難しいサンプルに
  • NGS パフォーマンスを改善
  • このキットで算出した Sample Quality Score に基づいて、SureSelect XT Low Input(200 ng スタート)プロトコルの実験条件およびシーケンス条件を最適化し、収量やターゲットカバレッジを改善
  • 使いやすい qPCR ベース
  • SYBR Green による qPCR ベースのキットで、Agilent AriaMx の他にも各社qPCR 装置に対応
  • 段階希釈済みスタンダードサンプルがキットに含まれるので便利
  • がん研究に、サンプル QC からデータ解析まで一貫したソリューション

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製品情報

  • 型番   製品名
    G9700A   Agilent NGS FFPE QC キット, 16 サンプル分
    G9700B   Agilent NGS FFPE QC キット, 96 サンプル分

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