ハイブリダイゼーションベースの次世代シーケンシング（NGS）
[RUO]
SureSelect Strand-Specific RNA ライブラリ調製キットは、全トランスクリプトームシーケンシングを対象に、ポリ-A エンリッチメントライブラリを調製します。広範な RNA のシーケンスを行い、遺伝子発現の変化や選択的スプライシングを検出します。キットには mRNA シーケンシングライブラリ調製試薬およびエンリッチメント試薬が含まれています。 必要最低限の手作業により、50 ng の少ない RNA から、わずか 5 時間でライブラリを生成できます。これらのライブラリは、5’ 末端から 3’ 末端までの転写産物カバレッジバイアスに限定された、非常に複雑なシーケンシングライブラリを生成する一方で、ストランド特異性が維持されています。ライブラリはイルミナ社のシーケンサに対応しています。 本製品は、研究用です。その他の用途にご利用いただくことはできません。※製品はすべて試験研究用です。診断目的にご利用いただくことはできません。
| 型番 | 製品名 | |
| G9691A | SureSelect Strand Specific RNA ライブラリ 調製試薬, 16反応, イルミナ対応 | |
| G9691B | SureSelect Strand Specific RNA ライブラリ 調製試薬, 96反応, イルミナ対応 |
ストランド特異性により、オーバーラップ転写産物からのリードの由来、およびアンチセンス転写産物が発現しているかどうかを判断できます。標準の RNA-シーケンシングプロトコルでは、RNA サンプルのライブラリ調製の結果として、この情報が失われます。
キットはウラシル DNA グリコシラーゼとアクチノマイシン D を使用して 99 % 以上のストランド特異性を取得し、確実に転写産物の方向を判定できます。
複雑性の高いライブラリは、同じリードを繰り返しシーケンスすることなく、サンプルについて新たな知見を得るために重要です。インプット量わずか 50 ng の total RNA を使用した場合、SureSelect Strand-Specific RNA ライブラリ調製キットでは、低い重複率でユニークな転写産物を多数検出できます。
多くの従来の RNA-シーケンシングライブラリ調製メソッドでは、転写産物のカバレッジが不均一であるため、明確な 3’ シーケンシングバイアスがあります。したがって、十分な 5’転写産物カバレッジを得るために、より深くシーケンスしなければならない可能性があります。分解が進んでいない RNA を使用している場合に、転写産物全体でより優れたカバレッジを得られるよう、SureSelect Strand-Specific RNA ライブラリ調製キットでケミストリは最適化されています。
外部標準 RNA を用いた性能評価