Agilent SureSelect テクノロジーを用いたターゲットエンリッチメント

Pub.No. 5994-8490JAJP

ナノポアシーケンシングプラットフォームによるターゲットシングルセルシーケンシング

ロングリードによるシングルセル RNA シーケンシングは、アイソフォームや融合トランスクリプトなどのより正確なトランスクリプトの情報を維持したまま、シングルセル分解能で解析を行うことができます。このアプリケーションノートでは、Agilent SureSelect テクノロジーを用いて、10x Genomics Chromium シングルセルライブラリのターゲットエンリッチメントを Oxford Nanopore Technologies シーケンシング用に行う方法を紹介します。この方法により、シングルセル解析に利用できる有効なリードの数が 増加し、目的の遺伝子の解析効率が向上します。さらに、この手法が Visium による空間的遺伝子発現解析にも適用できることも示します。

分野 ゲノミクス
キーワード Long Read Sequencing; Single-Cell Sequencing; Nanopore Sequencing; single-cell RNA sequencing; transcript analysis; isoforms transcripts; fusion transcripts; Oxford Nanopore; Visium spatial analysis; Single-cell RNA-Seq; scRNA-Seq; SureSelect XT HS; SureS 
掲載年月 2025/10
ページ数 11ページ (PDFファイルサイズ 6.73MB)

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