GeneSpring GX

ホットニュース

関連情報

特長

• 新たにゲノムコピー数解析を搭載 - CNV領域の検出、LOH解析、アレル特異的コピー数変異や複数サンプル間の共通変異領域の抽出を行うことができます。

• 新たにゲノムワイドアソシエーション解析（GWAS）機能を搭載 - 膨大なデータのハンドリングや実験誤差の補正機能・各種フィルタリング機能を搭載し、表現系と関連のあるSNPsやハプロタイプの検出を行います。

• トランスクリプトーム解析 - 各社の遺伝子発現アレイ、microRNAアレイ、選択的スプライシング、その他のデータを解析することが可能です。

• mRNA-miRNA の統合解析 - 複数の miRNA のターゲット候補遺伝子を一括で検索し（TargetScan）、mRNA 発現データを確認することができます。

• 生物学的な解釈 - 各種フィルタや統計解析でピックアップした遺伝子リストに対して、GO解析、GSEA、GSAとパスウェイ解析を行うことができます。

• ゲノムブラウザ機能を強化 - 異なるオミクスデータのオーバーレイや、各種公共アノテーショントラックの表示ゲノムブラウザーで極めてインタラクティブに閲覧することができます。

• パスウェイ解析 - 論文からNLP（自然言語処理）機能で自動抽出された独自の相互作用データベースを用い、ユーザーがピックアップした分子と相互作用のある分子を論文情報から検索することができます。対応生物種を順次追加予定。

• パターン抽出 - オミクスデータから興味深いパターンを抽出するPCA（主成分分析）や各種クラスタリング、各種クラス予測アルゴリズムを搭載

• 拡張性 - GeneSpring GX の機能を拡張することが可能な JYTHON API の搭載、R の統合により R 言語の利用が可能です。

• GeneSpring Workgroup - 膨大なマルチオミクスデータの一元管理・保存・メタ解析にはGeneSpring GXのserver base solutionであるGeneSpring Workgroupが有効です。