ハイブリダイゼーションベースの次世代シーケンシング(NGS)

ターゲット RNA-シーケンシング用 SureSelectXT RNA Direct ライブラリ調製キット

[RUO]

SureSelectXT RNA Direct は、ターゲット RNA シーケンシングのために、分析困難なサンプルから cDNAライブラリを生成するためのライブラリ調製キットです。RNA-Seq ライブラリは、SureSelect RNA ターゲットエンリッチメントプローブを使用してカスタム転写産物のために濃縮されており、低頻度の融合トランスクリプト/転写産物のリードデプスを向上させます。

このキットは高度に分解された RNA(FFPE など)を扱うために最適化されており、ポリ-A エンリッチメントや rRNA 除去が不要で、ワークフローを効率化します。ライブラリはイルミナ社のシーケンサに対応しています。SureSelect RNA ターゲットエンリッチメントプローブは完全にカスタム可能です。

※製品はすべて試験研究用です。診断目的にご利用いただくことはできません。

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特長

  • FFPE 由来の RNA など、分解度の高い RNA から高品質のシーケンスデータを取得します。
  • 複数のサンプル保管条件から堅牢な遺伝子発現プロファイリングを得ることが可能です。
  • ターゲット RNA-Seq を使用することで RNA 融合トランスクリプト感度を向上させます。
  • ポリ-A エンリッチメントや rRNA 除去を解消し、ワークフローを効率化します。
  • カスタムおよび市販の SureSelect RNA ターゲットエンリッチメントパネルまたはプローブで SureSelectXT RNA Direct を活用できます。

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仕様

  • エンリッチメント回数
    • 16~96

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用途

  • SureSelectXT RNA Direct

    このキットでは、アジレントの SureSelect キャプチャ技術を用いて、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)または分解が進んでいない RNA からターゲット RNA シーケンシングを実行できます。

    これらの重要な臨床サンプルから抽出された RNA は低品質であることから、FFPE サンプルからシーケンスデータを生成することは困難です。 必ずしも RNA 品質を制御できない場合でも、優れた RNA-シーケンシング結果を得られるよう、SureSelectXT RNA Direct は最適化されています。

  • ターゲット RNA シーケンシングを用いた融合 RNA の高感度検出

    多くの場合に、生物学的に有意な RNA は低存在量です。これらの RNA は、多数の高存在量 RNA をシーケンシングしている場合に、全トランスクリプトームにおいて簡単に見失われてしまいます。アジレントの SureSelect RNA キャプチャ技術により、このような低存在量のターゲット(融合トランスクリプト、転写産物、SNP/アレル)を濃縮してからシーケンスすることができます。

  • RNA 品質を問わない堅牢な遺伝子発現

    異なるサンプル保管法間で遺伝子発現結果を比較する場合(FFPE と新鮮凍結の比較など)、理想的には、結果は十分な相関性を示します。このパネルは、強い相関のある結果をもたらすライブラリを作成することが検証されており、信頼性の高い遺伝子発現データが得られます。複数のサンプル保管法を扱っていても問題ありません。

    SureSelectXT RNA Direct は、ステップを削減し、バイアスやエラーが発生する機会を少なくすることで、従来の RNA-シーケンシングワークフローを向上させます。

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