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The end of trial-and-error electrophoresis
Agilent 2100 バイオアナライザ
データを確実なものに
一般的なゲル電気泳動はフラグメントをレーンごとに確認しなければならず、実験者によるばらつきが起こる主観的な手法です。
Agilent 2100 バイオアナライザでは、DNA、RNA、タンパク質のサンプルについてサイズ測定、定量、純度を評価します。この実績ある Agilent 2100 バイオアナライザが提供するものは:
CRISPR/Cas は急速に進化しゲノム編集の最も一般的な手法となっています。guide RNA (gRNA) は、特定の切断ターゲットに対して結合し Cas ヌクレアーゼを導くことにより効率的な遺伝子改変が可能となり、従来のクローニング手法よりも高速なプロセスを実現します。Agilent 2100 バイオアナライザは、gRNA の転写や機能をモニタリングするために活用できます。
in vitro transcription により合成された ｇRNA のサイズ測定および定量をすることが可能です。
標的部位の切断活性や変異の検出により、gRNAの機能性を確認することが推奨されています。
ベクター構築は、多くのゲノム編集ワークフローにおいて重要なステップです。改変遺伝子や DNA フラグメントが目的の機能を持つベクターに挿入されます。Agilent 2100 バイオアナライザは、制限酵素消化やシーケンスによって確認される構築済みベクターの解析をアシストします。
従来のクローニング方法や CRISPR/Casなどの新しい方法においても、DNA フラグメント (PCR アンプリコンから制限酵素消化まで) のサイズおよび定量の客観的な分析が必要です。
ゲノム編集によって作製されたベクターの配列を次世代シーケンスによって確認します。シーケンスを行う前にバイオアナライザで NGS ライブラリを確認することで、確実に最適化できます。
ゲノム編集の後、遺伝子および機能改変の効果を評価しなければなりません。RNA の分解度の評価は、意味のある遺伝子発現のデータを得るための重要な最初のステップです。分解の少ない RNA を使用することは、マイクロアレイ、qRT-PCR、RNA-Seq において大変重要です。
Agilent 2100 バイオアナライザには、totalRNA の分解度を確認するツール、RIN (RNA Integrity Number) が搭載されています。
ゲノム編集の後、遺伝子および機能改変の効果を評価しなければなりません。Agilent 2100 バイオアナライザは、タンパク質や複合体の機能解析が可能です。
不純物の検出や精製プロトコルの最適化を含め、発現パターンの評価やタンパク質の単離・精製のモニタリングが可能です。
Protein 用キットにより、還元および非還元状態の分析や低濃度のコンタミネーション、タンパク質、ペプチドの検出など、ゲノム編集した生物由来のタンパク質の特性解析が可能です。
本資料掲載の製品は全て研究用です。その他の用途にご利用いただくことはできません。
