Fragment Analyzer Systems
CRISPR による変異導入の効率的かつ正確な同定は、CRISPR/Cas9 ワークフローの重要な要素です。 ヘテロ二本鎖切断アッセイは、CRISPR 変異のイベントを同定するための簡単で正確かつコスト効率の良い方法です。
Agilent Fragment Analyzer System の CRISPR Discovery Gel Kit はヘテロ二本鎖アッセイのスクリーニングを自動で行い、フラグメントのサイジングおよび相対濃度を算出します。これらの情報は、ProSize data analysis software で自動的に処理され、編集効率および変異率などの重要な情報を示します。
本資料掲載の製品はすべて研究用です。その他の用途にご利用いただくことはできません。
CRISPR Discovery Gel Kit を用いて Agilent Fragment Analyzer System でヘテロ二本鎖切断アッセイを行ったフラグメントを分析しました。挿入または欠失を含むアンプリコンのみが切断され、予測されたフラグメントパターンを生じます。切断された割合は、ProSize data analysis software が自動的に算出します。
ssDNA テンプレートは HDR 効率を大幅に改善することが知られています。Fragment Analyzer System は、dsDNA テンプレートの酵素処理によって産生した ssDNA の品質管理に使用することができます。dsDNA テンプレートのサイズが正しく、ssDNA が dsDNA よりも小さなサイズで検出されることで、dsDNA の酵素処理の成功が確認できます。
